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Bonjour, j 'ai un exercice à faire et je suis bloquée. Pourriez vous m'aider s'il vous plaît? Voici l'énoncé Le promoteur du gène celZ précédemment cité veut être identifié. Le site d'initiation de la transcription est déterminé par la méthode d'extension d'amorce en utilisant l'oligonucléotide suivant: ExtZ: 5' TCTTATCCAAATAAGAGAGC 3' Le même oligonucléotide est utilisé pour réaliser une réaction de séquence par la méthode de Sanger. La réaction d'extension d'amorce et la réaction de séquence ont été chargées sur un gel. Forum biologie moléculaire 2019. Le résultat est le suivant: A partir de ce résultat, positionner le site d'initiation de la transcription et positionner les séquences « -35 » et « -10 ». ----------------------------- J'ai lu sur le gel la séquence du brin d'ADN complémentaire puis par complémentarité des bases trouve le brin. séquence: compléùentaire: 5' GTTAACTGTAAATAGAATAGAATAGGCGAT T/GGTTTT 3' cherché: 5' AAAACC/AATCGCCTATTCTATTCTATTACAGTTAAC 3' De plus je sais que la séquence -35 est AACTGT (par complémentarité TTGACA) et la séquence -10 est ATATTA (par complémentarité TATAAT).
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En fait, quand tu marques une séquence d'ADN simple brin, c'est forcément le brin sens, car tu écris toujours une séquence d'acide nucléique de 5' vers 3'. C'est une règle qu'il faut toujours respecter. Donc la séquence du transcrit primaire (qui est le transcrit du brin complémentaire à ta séquence) est directement donnée par ta séquence sauf que tu remplaces T par U! Donc pas besoin de s'embêter avec la complémentarité des bases! Ecrire une séquence de 3' vers 5' n'est valable que si tu as une séquence d'ADN double brin: respect de l'antiparallèlisme. LMC France - Le forum :: biologie moléculaire en hausse. SInon, si tu as une séquence orientée de 3' vers 5' tu dois ABSOLUMENT la réécrire de 5' vers 3', donc tu commences par la fin et tu finis par le début. J'ai dû me répéter mais c'est pour bien que tu comprennes ^^' 4; Le dernier nucléotide d'une séquence représentera ton extrémité libre 3'OH: sa fonction alcool secondaire en 3' est libre, elle n'est pas impliquée dans une liaison phosphoester. Quand tu ajoutes un nouveau nucléotide dans une séquence, la polymérisation se fait grâce à la fonction alcool 3'OH et non pas grâce au phosphate en 54 = tu branches le phosphate 5' de ton NOUVEAU nucléotide à la fonction alcool 3'OH du nucléotide PRÉCÉDENT.
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C'est en fait l'inverse de ton raisonnement. En conséquence, le 1er nucléotide de la séquence a un phosphate libre (extrémité 5') et le dernier a sa fonction alcool (ribose ou désoxyribose) en 3' libre (extrémité 3'). Ensuite: - Nucléoside = base azotée + ose (ribose ou désoxyribose) - Nucléotide = base azotée + ose + Phosphate = nucléoside + phosphate Si tu considères seulement des nucléosides (rouge), tu auras un pont/ une liaison phosphodiester entre les 2 (bleu) Capture d'écran 2021-11-11 à Par contre, si tu considères des nucléotides (noir), tu considères que chaque phosphate appartient à un seul nucléoside = tu prends en compte le phosphate dans la structure du nucléotide. Tu as alors une liaison phosphoester entre chaque nucléo t ide cette fois-ci. Capture d'écran 2021-11-11 à Entre 2 nucléo s ides: 1 liaison phospho di ester Entre 2 nucléo t ides: 1 liaison phosphoester J'espère t'avoir éclairé au mieux sur ces notions assez vilaines. Forum biologie moléculaire de montpellier. Révise bien la bio mol, c'est une partie incontournable en Biochimie et une des plus difficiles sûrement!
A bientôt et bon courage pour ce dernier mois de dur labeur, c'est la dernière ligne droite! Au plaisir:) Vous n'avez pas les permissions nécessaires pour voir les fichiers joints à ce message.